タイムカードに関して、大きく３つの問題点があります。
1.勤怠管理の時間が正確に記録されていない
2.手作業や集計が多く、非効率である
3.集計されるまで残業時間が把握できない
タイムカードの問題点を改善するには、システムを導入することが最も効果的です。
1.勤怠管理の時間が正確に記録されていない
システムへログイン（本人認証）し、勤怠時間を記録することで可能です。フェリカや指紋認証で記録を取ることも可能です。
また、遡って記録の修正を禁止する機能で、改ざんを防止することが可能となります。
一度、記録した時間をまったく修正出来ないのも問題ですので、上長との承認機能で承認後は変更を禁止する場合が殆どです。
2.手作業や集計が多く、非効率である
システム（コンピューター）が得意とする機能です。
勤怠時間を記録（打刻）すると共に、時間の丸めや勤務時間や残業時間を自動集計することができます。
また、従業員、グループ（部門）、全社単位での集計もリアルタイムで行い、クラウドを利用することで、場所と時間を選ばず何処からでも確認することができます。
毎月度、従業員ごとにタイムカードを準備し回収する作業も無くなります。
3.集計されるまで残業時間が把握できない
上記同様に、リアルタイムに従業人・グループ・部門・全社の勤怠情報が確認できます。
そして、問題は導入費用ではないでしょうか？
高額で高機能なシステムを導入しても、費用対効果を考えませんとシステムを導入する意味がありません。
最近では、クラウドを活用することでシステムの導入・運用費が削減できます。
クラウド型の勤怠管理やタイムカードシステムを検討しては如何でしょうか。